EVENTO
ANÁLISE COMPUTACIONAL DA DIVERSIDADE GENÉTICA E INVESTIGAÇÃO DA ESTABILIDADE DA VACINA BRASILEIRA CONTRA A FEBRE AMARELA
Tipo de evento: Defesa de Dissertação de Mestrado
A vacina contra a Febre Amarela é produzida utilizando um processo de atenuação viral e atualmente possui duas linhagens, sendo que uma delas (17DD) é exclusiva do Brasil. As altas taxas de diversidade genética inerentes à replicação de vírus de RNA criam uma grande diversidade alélica nas populações virais, e são frequentemente chamadas dos quasispecies. A presença de diversas quasispecies nos lotes vacinais, que podem se alterar ao longo das passagens sequenciais na preparação dos lotes de distribuição, pode estar relacionada com a reversão à virulência em genótipos atenuados. O presente trabalho tem como principal objetivo investigar a diversidade e estabilidade genética de lotes vacinais da linhagem 17DD utilizando abordagens de biologia computacional. Foram utilizados dados de sequenciamento de nova geração, que permitiram identificar as variantes genéticas e as quasiespecies existentes nos lotes da vacina brasileira, além da montagem e anotação de diversos novos genomas da variante brasileira da vacina do vírus da febre amarela. Para realizar essas análises foi desenvolvido um workflow científico chamado V2IDA, que utiliza diversas ferramentas computacionais para identificar as variantes alélicas e quasiespecies dos lotes vacinais de maneira automatizada. Utilizando esta nova ferramenta foram identificadas as quasispecies virais presentes em diversos lotes vacinais e como principal resultado foi possível a constatação da estabilidade da vacina brasileira. Além sido o workflow desenvolvido neste trabalho permite a análise in silico de linhagens vacinais antes possíveis somente com experimentos laboratoriais.
Data Início: 19/02/2020 Hora: 09:30 Data Fim: 19/02/2020 Hora: 12:00
Local: LNCC - Laboratório Nacional de Computação Ciêntifica - Sala 03 - Pós-Graduação
Aluno: Amanda Araújo S. Andrade - Laboratório Nacional de Computação Científica - LNCC
Orientador: Ana Tereza Ribeiro de Vasconcelos - Laboratório Nacional de Computação Científica - LNCC André Elias Rodrigues Soares - -
Participante Banca Examinadora: Ana Tereza Ribeiro de Vasconcelos - Laboratório Nacional de Computação Científica - LNCC Luciane Prioli Ciapina - Laboratório Nacional de Computação Científica - LNCC Marco Alberto Medeiros - FIOCRUZ -
Suplente Banca Examinadora: Marisa Fabiana Nicolás - Laboratório Nacional de Computação Científica - LNCC Nicholas Costa Barroso Lima - LNCC - LNCC
